"نگهبانان ماه: نبرد دوباره" فصل جدیدی در ماجراجویی‌های "نگهبانان ماه" را رقم می‌زند. آرامشی که به سختی به دست آمده بود، با ظهور دشمنی جدید، به خطر می‌افتد. این دشمن قدرتمند، مصمم است تا با قدرت‌های تاریک خود، صلح را از بین ببرد. نگهبانان ماه باید یک‌بار دیگر برای محافظت از زمین و عزیزانشان متحد شوند و با این تهدید جدید مبارزه کنند.

پس از یک فاجعه بی سابقه، کل تمدن مدرن دنیا نابود شده است. گروهی از بچه ها در مکانی کاملا محافظت شده زندگی می کنند. یکی از دختران این مکان پیامی دریافت می کند مبنی بر اینکه آیا دلش می خواهد بیرون برود و ...

داستان انیمه در مورد خلبانی به نام "آمورو ری" که به همراه خدمه پایگاه سفید، ماموریت پیدا می‌کند برای نابودی نیروهای دشمن، به جزیره‌ای دور افتاده به نام جزیره بدون بازگشت سفر کند. اما ....

آکادمی دختران Ooari یک بار دیگر دور هم جمع میشوند و با دختران باشگاه Tankery باید در مسابقه دیگری شرکت کنند تا مدرسه خود را از بستن دائمی حفظ کنند!